Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB7P09629 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HOXB7P09629 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms