Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFMP07197 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFMP07197 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFMP07197 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFMP07197 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEFMP07197 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEFMP07197 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEFMP07197 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEFMP07197 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFMP07197 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFMP07197 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFMP07197 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFMP07197 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFMP07197 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFMP07197 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFMP07197 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFMP07197 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFMP07197 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFMP07197 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFMP07197 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFMP07197 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFMP07197 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFMP07197 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFMP07197 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFMP07197 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFMP07197 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFMP07197 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFMP07197 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFMP07197 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFMP07197 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFMP07197 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFMP07197 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFMP07197 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFMP07197 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFMP07197 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFMP07197 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFMP07197 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms