Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HLA-DOAP06340 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-DOAP06340 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms