Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
POLR3DP05423 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms