Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB4AP04350 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB4AP04350 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms