Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DRAP01903 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DRAP01903 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DRAP01903 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DRAP01903 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DRAP01903 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms