Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1RP00736 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1RP00736 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1RP00736 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C1RP00736 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1RP00736 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1RP00736 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1RP00736 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1RP00736 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1RP00736 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1RP00736 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1RP00736 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1RP00736 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1RP00736 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1RP00736 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1RP00736 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1RP00736 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1RP00736 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1RP00736 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1RP00736 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1RP00736 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C1RP00736 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1RP00736 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1RP00736 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1RP00736 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms