Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN3O95197 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN3O95197 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN3O95197 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN3O95197 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN3O95197 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN3O95197 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN3O95197 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN3O95197 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN3O95197 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN3O95197 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN3O95197 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN3O95197 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN3O95197 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN3O95197 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN3O95197 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN3O95197 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN3O95197 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN3O95197 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN3O95197 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN3O95197 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN3O95197 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN3O95197 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN3O95197 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN3O95197 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN3O95197 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN3O95197 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN3O95197 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN3O95197 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN3O95197 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN3O95197 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN3O95197 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN3O95197 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN3O95197 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN3O95197 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN3O95197 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN3O95197 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN3O95197 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN3O95197 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN3O95197 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN3O95197 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms