Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFASCO94856 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFASCO94856 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFASCO94856 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFASCO94856 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFASCO94856 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFASCO94856 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFASCO94856 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFASCO94856 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFASCO94856 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFASCO94856 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFASCO94856 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFASCO94856 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFASCO94856 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFASCO94856 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NFASCO94856 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFASCO94856 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFASCO94856 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFASCO94856 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFASCO94856 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFASCO94856 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFASCO94856 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFASCO94856 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFASCO94856 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFASCO94856 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFASCO94856 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFASCO94856 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFASCO94856 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFASCO94856 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFASCO94856 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFASCO94856 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFASCO94856 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFASCO94856 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFASCO94856 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NFASCO94856 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFASCO94856 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFASCO94856 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFASCO94856 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFASCO94856 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFASCO94856 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFASCO94856 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFASCO94856 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NFASCO94856 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFASCO94856 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms