Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN5O94779 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms