Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOO75962 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOO75962 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOO75962 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOO75962 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOO75962 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOO75962 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOO75962 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOO75962 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOO75962 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOO75962 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOO75962 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOO75962 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOO75962 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOO75962 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOO75962 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOO75962 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOO75962 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOO75962 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOO75962 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOO75962 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOO75962 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIOO75962 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIOO75962 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOO75962 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOO75962 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms