Protein–RNA interactions for Protein: O75844

ZMPSTE24, CAAX prenyl protease 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMPSTE24O75844 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMPSTE24O75844 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZMPSTE24O75844 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms