Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP2O75563 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms