Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP2O75323 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP2O75323 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms