Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1FO60840 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1FO60840 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CACNA1FO60840 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CACNA1FO60840 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1FO60840 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1FO60840 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1FO60840 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1FO60840 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1FO60840 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1FO60840 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1FO60840 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1FO60840 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1FO60840 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1FO60840 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1FO60840 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1FO60840 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms