Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
KIAA0556O60303 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KIAA0556O60303 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms