Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAK2O60296 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK2O60296 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms