Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP9BO43861 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP9BO43861 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms