Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP3O43295 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms