Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLOCKO15516 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms