Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR1CO15160 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR1CO15160 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms