Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKBO14920 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IKBKBO14920 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKBO14920 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms