Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IFIT3O14879 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFIT3O14879 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms