Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRTO14522 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRTO14522 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
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