Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF103O00237 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF103O00237 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF103O00237 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF103O00237 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF103O00237 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF103O00237 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF103O00237 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF103O00237 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF103O00237 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF103O00237 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF103O00237 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF103O00237 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF103O00237 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF103O00237 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF103O00237 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF103O00237 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF103O00237 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF103O00237 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF103O00237 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF103O00237 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF103O00237 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF103O00237 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF103O00237 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF103O00237 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF103O00237 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF103O00237 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF103O00237 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF103O00237 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF103O00237 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF103O00237 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF103O00237 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms