Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCER2I3L3R5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCER2I3L3R5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCER2I3L3R5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms