Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BRB1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BRB1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BRB1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BRB1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BRB1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BRB1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BRB1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BRB1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BRB1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BRB1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BRB1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BRB1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BRB1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BRB1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BRB1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BRB1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BRB1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BRB1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BRB1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BRB1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BRB1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BRB1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BRB1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BRB1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BRB1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BRB1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BRB1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BRB1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BRB1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BRB1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BRB1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BRB1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BRB1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BRB1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BRB1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BRB1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BRB1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BRB1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BRB1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BRB1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BRB1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BRB1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BRB1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BRB1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BRB1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BRB1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BRB1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BRB1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BRB1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BRB1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BRB1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BRB1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BRB1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BRB1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BRB1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BRB1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BRB1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BRB1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BRB1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BRB1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BRB1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms