Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MCRIP1C9JLW8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms