Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00587B1AMM8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms