Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YJEFN3A6XGL0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms