Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NNZ2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NNZ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NNZ2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NNZ2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNZ2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNZ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNZ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNZ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNZ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNZ2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NNZ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NNZ2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NNZ2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NNZ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms