Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GMNCA6NCL1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms