Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VWA3AA6NCI4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms