Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM149AA5PLN7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM149AA5PLN7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms