Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf170A2RU37 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms