Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRGMA1A4Y4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms