Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GNGT2-204ENST00000511277 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SEPT3-202ENST00000396425 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IGSF3-202ENST00000369483 7326 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ZC3HC1-203ENST00000360708 1676 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ASB9-202ENST00000380485 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC011525.2-202ENST00000590611 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FAM47A-202ENST00000613251 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RPS6KA2-203ENST00000405189 2282 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NAB1-201ENST00000337386 4358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PAMR1-205ENST00000611014 2613 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SALL2-207ENST00000614342 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 OLFML3-201ENST00000320334 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MYF5-201ENST00000228644 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SMUG1-AS1-201ENST00000634796 1734 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 KCNJ3-203ENST00000544049 4523 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CARMN-210ENST00000602964 8398 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CASS4-201ENST00000360314 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 UBA3-203ENST00000415609 2004 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ABCD1-201ENST00000218104 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GP1BA-201ENST00000329125 2501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 PRPF4-202ENST00000374199 3212 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NICN1Q9BSH3 SV2C-201ENST00000322285 3010 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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