Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF548-201ENST00000336128 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF805-202ENST00000414468 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FAR1-201ENST00000354817 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CCDC144NL-AS1-216ENST00000582583 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PKP1-202ENST00000352845 2244 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IGSF11-208ENST00000489689 3320 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GGA3-205ENST00000578348 2251 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ITGA7-213ENST00000555728 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SLC13A5-201ENST00000293800 3176 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ENO4-203ENST00000409522 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AWAT2-201ENST00000276101 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ENDOU-202ENST00000422538 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TAF1A-AS1-201ENST00000413074 1313 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ELP3-218ENST00000524103 1914 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SLC25A25-202ENST00000373066 3714 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PTPN7-201ENST00000309017 3765 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TP53-206ENST00000455263 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TP53-219ENST00000610538 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SIPA1L2-202ENST00000308942 2937 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PRKACB-206ENST00000370689 4513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PIPSL-202ENST00000489875 2733 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 WDR93-201ENST00000268130 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PARD3B-202ENST00000351153 3411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ADCY4-204ENST00000554068 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 DUSP27-202ENST00000361200 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ZNF691-204ENST00000372506 1859 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PRAMEF9-201ENST00000415919 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL591643.1-201ENST00000561587 1900 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AP002409.1-201ENST00000584722 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RASSF8-203ENST00000405154 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC004947.2-201ENST00000623092 2671 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC010746.1-201ENST00000442984 452 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC009305.1-201ENST00000449780 368 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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