Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 LINC00595-212ENST00000634933 1544 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MRPL22-207ENST00000523037 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ARSF-201ENST00000359361 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TMEM136-201ENST00000314475 1434 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 NMUR2-201ENST00000255262 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SV2C-201ENST00000322285 3010 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LMO3Q8TAP4 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LMO3Q8TAP4 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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LMO3Q8TAP4 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SIGLEC6-206ENST00000436458 1713 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 UBASH3A-202ENST00000319294 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A8P-201ENST00000432432 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CFAP36-202ENST00000349456 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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LMO3Q8TAP4 NPSR1-209ENST00000531252 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CD300LF-202ENST00000326165 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AMD1P4-201ENST00000299540 1345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PCYT1B-202ENST00000379144 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CDNF-202ENST00000378442 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL590068.2-201ENST00000426067 378 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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