Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQK5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQK5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQK5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQK5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQK5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQK5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQK5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQK5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQK5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQK5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQK5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQK5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQK5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQK5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms