Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
MAP3K4Q9Y6R4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.81■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.81■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms