Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDY1Q9Y6F8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDY1Q9Y6F8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms