Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAD1L1Q9Y6D9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms