Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNX13Q9Y5W8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms