Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHLDA3Q9Y5J5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms