Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.6 ms