Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9Y3F1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9Y3F1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms