Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MED16Q9Y2X0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED16Q9Y2X0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED16Q9Y2X0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED16Q9Y2X0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED16Q9Y2X0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED16Q9Y2X0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED16Q9Y2X0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED16Q9Y2X0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms