Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BTRCQ9Y297 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BTRCQ9Y297 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms