Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms